Das erste im Ennstal nachzuweisende Volk sind die Illyrer, die Gründer der Hallstattkultur. Auch der Name Stiriate ist illyrischer Herkunft. Das Grundbuch der Pfarre Gröbming weiß von einem Haus zu berichten, das auf der "Steinernen Mauer zu Pruckhern" erbaut war.

Dies würde bedeuten, dass Pruggern ca 1700 Jahre alt ist. Das Wort Pruggern ist jedoch deutschen Ursprungs und seine älteste Form lautet "Prukkaren". Das ist ein zusammengesetztes Wort, das Bestimmungswort ist "Prukk" für Brücke und "arn" für Land - "Land an der Brücke".

Die ersten deutschen ("bairischen") Siedler waren im 8. Jahrhundert ins Ennstal gekommen, eine zweite Siedlungswelle folgte im 9. Jahrhundert. In diesem Jahrhundert dürfte das Dorf Pruggern gegründet worden sein.

Die erste Nennung des Namens hängt mit der Gründung des Stiftes Admont im Jahre 1074 zusammen, wo Pruggern urkundlich erwähnt wurde.

Es folgte die Besiedelung durch bäuerliche Landbevölkerung. Ab dem 15. Jahrhundert ließen sich auch einige Gewerbebetriebe in Pruggern nieder.

1822 fand eine Zählung der Menschen und des Viehstandes statt. Sie ergab einen Flächeninhalt von 2380 Joch, wovon 955 Joch auf Waldungen, 592 Joch auf Wiesen, 435 Joch auf Weiden und 380 Joch auf Äcker entfielen. Die Zahl der einheimischen Bewohner betrug 402, wovon 202 weiblichen Geschlechts waren. Der Viehstand belief sich auf 36 Pferde, 21 Ochsen, 301 Kühe und 388 Schafe. Wohnhäuser (mit Almhütten) wurden 88 gezählt.

Bis zum heutigen Tage entwickelte sich Pruggern zu einem stetig wachsenden Dorf mit Schulstandort und landwirtschaftlichen und gewerblichen Betrieben. Eine Haupt-einnahmequelle des Dorfes ist der wachsende Wintertourismus im Ort und der Region.
Die steinerne Brücke ist noch immer Teil des Gemeindewappens von Pruggern.